吞咽困难的治疗需根据病因来定。如果是咽部疾病导致的吞咽困难，比如咽炎，可使用一些含漱液来缓解症状，像复方硼砂含漱液，能清洁口腔、杀菌消炎，有助于减轻咽部炎症引起的吞咽不适，但具体使用需在医生指导下进行。
因口咽部疾病导致的治疗
咽炎相关治疗：除了使用含漱液，还需注意休息，多喝水，一般来说，通过规范治疗，多数咽炎引起的吞咽困难在1 - 2周内可逐渐缓解。如果是扁桃体炎导致的吞咽困难，若扁桃体炎是细菌感染引起，可能会用到抗生素，比如青霉素类抗生素，但具体用药要依据病情由医生判断。口腔问题导致：如果是口腔溃疡引起的吞咽困难，可使用口腔溃疡散等药物，能促进溃疡面愈合，一般口腔溃疡在1 - 2周左右能愈合，吞咽困难也会随之改善。同时要注意保持口腔清洁，饭后及时漱口。
因食管疾病导致的治疗
食管炎相关：反流性食管炎导致的吞咽困难，患者要注意少食多餐，避免吃辛辣、油腻等刺激性食物。可以使用质子泵抑制剂，如奥美拉唑等药物，抑制胃酸分泌，一般经过规范治疗，1 - 2个月左右症状可明显改善。如果是食管狭窄导致的吞咽困难，可能需要进行内镜下扩张等治疗。食管癌相关：如果是食管癌引起的吞咽困难，早期可能需要通过手术治疗，中晚期可能需要综合治疗，包括放疗、化疗等，但具体治疗方案要根据患者的病情分期等情况由医生制定。
因神经系统疾病导致的治疗
脑卒中相关：如果是脑卒中引起的吞咽困难，在急性期要积极治疗脑卒中本身，同时可进行吞咽功能康复训练。康复训练需要在专业康复师指导下进行，一般需要数周甚至数月的训练，部分患者吞咽功能可逐渐改善。帕金森病相关：帕金森病导致的吞咽困难，可使用一些改善帕金森病症状的药物，如多巴丝肼等，但药物使用要遵循医生的指导。同时也需要进行吞咽功能训练，训练要长期坚持，有助于缓解吞咽困难的情况。