小便时阴道疼可能由阴道炎、尿道炎、尖锐湿疣、阴道肿瘤等原因引起。具体如下：
一、阴道炎：这是各种原因引发的阴道炎症。排尿时阴道可能出现瘙痒、疼痛、灼热感等症状。其原因可能多种多样。如果是阴道炎导致排便时阴道疼痛，建议女性按医嘱使用药物进行治疗，如：
1.甲硝唑片：可用于治疗滴虫性阴道炎等。
2.盐酸克林霉素片：对一些细菌性阴道炎有治疗作用。
3.制霉菌素片：常用于霉菌性阴道炎的治疗。
二、尿道炎：主要是各种病原体导致的尿道感染，主要表现有尿道痒、尿痛、尿道口红肿等。由于女性尿道与阴道位置临近，排尿时可能引发阴道疼。一般来说，女性可按医嘱使用如下药物治疗：
1.银花泌炎灵片：有助于缓解尿道炎症状。
2.盐酸多西环素片：可用于治疗尿道炎。
3.盐酸米诺环素片：对特定类型的尿道炎有效。
三、尖锐湿疣：若患者性生活混乱、不注意个人卫生等，容易感染人乳头瘤病毒而导致尖锐湿疣，进而造成阴道疼痛、瘙痒等情况。治疗可采用如下方法：
1.冷冻疗法：通过冷冻使疣体坏死脱落。
2.电灼疗法：利用电灼来去除疣体。
四、阴道肿瘤：阴道疼痛也可能是阴道肿瘤所致。
总之，当出现小便时阴道疼的情况，应及时就医，排除重症疾病风险，明确病因后积极进行治疗。