细菌性脑炎和病毒性脑炎在症状、脑脊液、治疗、病原体及后遗症等方面存在区别。具体如下：
一、症状
1.细菌性脑炎常有全身寒战、高热不退等表现，而病毒性脑炎一般无全身寒战，且发热程度通常低于细菌性脑炎。
二、脑脊液
1.病毒性脑炎的脑脊液外观清亮，常规检查细胞数通常小于50个，以淋巴细胞为主，生化检查时蛋白质正常或轻度升高，糖和氯化物正常。
2.细菌性脑炎的脑脊液外观浑浊，化验检查时生化检查蛋白质明显增高，糖和氯化物明显减低，且脑脊液中可查到相关细菌。
三、治疗方法
1.病毒性脑炎主要进行抗病毒治疗。
2.细菌性脑炎主要采用抗生素治疗。
四、病原体
1.病毒性脑炎由病毒感染引起，如肠道病毒、单纯疱疹病毒等。
2.细菌性脑炎由细菌感染导致，如流感杆菌感染、肺炎球菌感染、大肠杆菌、李斯特菌感染、厌氧菌感染等。
五、后遗症
1.细菌性脑炎较特异性的后遗症包括梗阻性脑积水、硬膜下积液、积脓、脑脓肿等。
2.病毒性脑炎后遗症中脑软化较为多见。
总结概况提示：细菌性脑炎和病毒性脑炎在多个方面存在显著差异，准确区分对于诊断和治疗具有重要意义。