非淋菌性尿道炎主要由沙眼衣原体、解脲支原体等病原体感染引起，治疗常用的药物有四环素类、大环内酯类等。一般来说，规范使用抗生素类药物大多能取得较好疗效。
常用治疗药物种类
四环素类药物： 多西环素是常用的四环素类药物，它能抑制病原体蛋白质合成，从而发挥抗菌作用。不过，8岁以下儿童通常不建议使用多西环素，因为可能会影响牙齿发育等。大环内酯类药物： 阿奇霉素较为常见，它可以阻碍细菌转肽过程，抑制细菌蛋白质合成。孕妇在使用阿奇霉素时需谨慎，最好在医生评估后使用；肝功能不全的患者使用时也需要密切监测。还有红霉素，它通过与细菌核糖体50S亚基结合，抑制细菌蛋白质合成来发挥作用，但部分人使用后可能会出现胃肠道不适，如恶心、呕吐等症状。
不同病原体感染的用药倾向
沙眼衣原体感染： 一般首选多西环素，疗程通常为7 - 10天。如果患者对多西环素不耐受，可考虑用阿奇霉素，阿奇霉素通常单次口服1g即可，但要注意用药后可能出现的胃肠道反应。解脲支原体感染： 同样可以选用多西环素，用法用量基本同沙眼衣原体感染的情况。也可以选择阿奇霉素，不过具体的用药选择还得根据患者的具体病情、既往用药史等综合判断。
特殊人群用药注意事项
孕妇患者： 孕妇感染非淋菌性尿道炎时用药需格外谨慎。像四环素类药物绝对禁用，因为会影响胎儿骨骼和牙齿发育。大环内酯类中的阿奇霉素相对相对安全些，但也需要在医生指导下使用，要权衡利弊后确定是否选用以及具体的用药方案。儿童患者： 8岁以下儿童一般不推荐使用四环素类药物来治疗非淋菌性尿道炎。对于儿童的支原体、衣原体感染，可能会选用大环内酯类的阿奇霉素等，但剂量需要严格按照儿童的体重等进行计算，并且要密切观察用药后的反应，如是否有胃肠道不适、过敏等情况发生。