IgA肾病的严重程度取决于临床分级和症状的严重程度。依据LEE分级，通常Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ级的IgA肾病症状偏轻，不算严重，而Ⅳ、Ⅴ级的IgA肾病，其肾小管和肾间质改变显著，较为严重。
一、不严重的情况：
1.在LEE分级里的Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ级，肾小管和肾间质基本无改变，肾小球状况也相对良好。此时在治疗方面，若有反复的肉眼血尿，就需要控制感染，可选用无肾毒性的抗生素，比如肌肉注射青霉素、口服红霉素、口服头孢菌素等；要是伴有蛋白尿，则可选用ACEI（血管紧张素转化酶抑制剂）或ARB（血管紧张素受体拮抗剂）进行治疗，像卡托普利、缬沙坦等。一般经过治疗，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ级患者的预后通常较好。
二、严重的情况：
1.LEE分级中的Ⅳ、Ⅴ级，肾小管和肾间质有明显损伤，通常可见肾小管萎缩、间质浸润以及肾小球新月体等。若还伴有肌酐的升高，那么病情就相当严重了。此时需要使用大剂量免疫抑制剂或者其他的细胞毒药物，例如糖皮质激素、环磷酰胺等，必要时还需进行透析治疗，在这种情况下IgA肾病就属于比较严重的阶段，可能会出现肾病综合征或肾衰竭等状况，预后较差。
IgA肾病有可能是因为循环中的免疫复合物在肾脏内沉积，激活补体从而导致肾损害。IgA肾病的10年肾脏存活率为80%至85%，20年约为65%，不过个体差异较大，有些患者能长期预后良好，但有些患者可能会快速进展为肾衰竭。
总结：IgA肾病严重程度需综合临床分级与症状判断，不同级别症状和治疗方式有差异，其发病原因可能与免疫复合物沉积等有关，且预后情况存在个体差异。