女生来大姨妈时腰疼，主要是因为前列腺素分泌增加。月经期间，子宫内膜会合成并释放较多的前列腺素，前列腺素除了会引起子宫收缩导致痛经外，还可能引起腰部等部位的疼痛，大约有30% - 40%的女性在经期会出现不同程度的腰疼情况。
激素变化影响
盆腔充血因素：月经期间，女性盆腔处于充血状态，这种充血可能会刺激周围的神经，从而引发腰部的不适感。一般月经前1 - 2天开始出现盆腔充血，经期时这种充血状态会持续，可能导致腰疼症状逐渐明显。激素水平波动：月经期间雌激素和孕激素水平会发生波动，这种波动可能会影响腰部肌肉的紧张度。例如，雌激素水平变化可能会使腰部肌肉的敏感性增加，容易出现酸痛感。
子宫位置异常原因
后位子宫影响：有些女性的子宫是后位的，在月经期间，后位子宫会对周围的组织和神经产生牵拉等刺激。子宫后位时，经期子宫收缩排出经血的过程中，可能会对后方的神经等结构造成影响，进而引起腰疼。一般后位子宫的女性中，有一定比例在经期会出现腰疼情况。子宫过度前倾前屈：相反，子宫过度前倾前屈时，也可能在月经期间因为子宫的位置异常，导致经血排出不畅等情况，从而引起腰部的反射性疼痛。这种过度前倾前屈的子宫在人群中也有一定发生率，经期时容易出现腰疼。
疾病相关因素
盆腔炎影响：如果女性本身有盆腔炎，在月经期间，盆腔的炎症可能会加重，炎症刺激会导致腰部疼痛。盆腔炎患者中，约有20% - 30%的人在经期会出现腰疼加重的情况。盆腔炎是由细菌等病原体感染盆腔引起的炎症性疾病。子宫内膜异位症作用：子宫内膜异位症患者，异位的子宫内膜会出现在盆腔等部位，在月经期间，异位的内膜也会出血等，刺激周围组织，引起腰部疼痛。子宫内膜异位症在育龄女性中的发生率约为10% - 15%，其中很多患者会在经期出现腰疼症状。