月经持续不干净且呈褐色的情况，可依据具体原因进行相应治疗，具体如下：
一、阴道炎：
1.阴道炎通常由细菌感染、真菌感染等引发，会致使患者出现月经不干净、呈褐色的现象，同时伴有阴道瘙痒、疼痛等症状。
(1)如果是细菌感染引起的阴道炎，患者可在医生指导下使用甲硝唑片、克林霉素等药物进行治疗。
(2)若是真菌感染引起的阴道炎，则可在医生指导下使用伊曲康唑、氟康唑等抗真菌药物来医治。
二、宫颈息肉：
宫颈息肉属于宫颈细胞异常增生形成的良性肿瘤，会导致患者月经不干净且呈褐色。患者可以采取宫颈息肉摘除手术进行治疗。
三、宫颈炎：
宫颈炎一般由细菌感染所致，会让患者月经不干净、呈褐色，还伴有阴道分泌物增多的表现。患者可在医生的指导下使用阿奇霉素、罗红霉素等抗生素药物予以治疗。
总之，当出现月经不干净且呈褐色时，应及时就医明确原因，并根据具体病因进行针对性治疗。