脐疝主要是由于脐部组织发育缺陷或薄弱，导致腹腔内容物突出形成。婴儿中约有4% - 10%会出现脐疝，尤其是早产儿发生率更高。
先天发育因素
胎儿时期脐环未闭合： 在胎儿发育过程中，脐环是腹壁的一个生理性通道，正常情况下，胎儿出生前后脐环会逐渐闭合。如果脐环没有按时完全闭合，就为脐疝的形成留下了基础。一般足月儿出生时脐环多已接近闭合，但部分早产儿或者发育相对迟缓的胎儿，脐环闭合不完全的概率会增加。脐部组织薄弱： 婴儿的脐部肌肉、筋膜等组织相对薄弱，相比成人脐部的结构强度较差，这使得腹腔内的肠管等组织更容易通过薄弱部位突出形成脐疝。
腹内压力增高因素
哭闹频繁： 婴儿时期哭闹是比较常见的情况，当婴儿剧烈哭闹时，腹腔内压力会明显升高。频繁且剧烈的哭闹会不断增加腹腔内的压力，促使腹腔内容物向外冲击脐部薄弱区域，从而诱发脐疝。比如有些婴儿每天哭闹时间超过2 - 3小时，就可能增加脐疝发生风险。便秘： 婴儿如果发生便秘，排便时需要用力屏气，这会导致腹腔内压力升高。长时间的便秘状态使得腹腔内压力持续处于较高水平，也容易推动腹腔内容物从脐部薄弱处突出形成脐疝。一般来说，婴儿如果连续3天以上没有正常排便，就可能存在便秘引发腹内压增高的情况。
其他因素
肥胖人群： 对于成年人来说，肥胖也是导致脐疝的一个重要因素。过度肥胖会使腹腔内脂肪堆积，腹腔内压力相对较高，同时腹部的组织受到脂肪的挤压等影响，脐部的组织承受的压力增大，容易出现脐疝。研究发现，体重指数（BMI）超过30的肥胖人群，脐疝的发生率比正常体重人群高很多。多次妊娠女性： 多次妊娠的女性，由于妊娠过程中腹部不断膨胀，脐部的组织反复受到牵拉等影响，容易导致脐部组织薄弱或者损伤，从而增加脐疝的发生几率。比如经产妇比初产妇发生脐疝的可能性要高一些，多次妊娠次数越多，风险相对越高。