手足口病主要是由肠道病毒引起的，其中肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A16型（CoxA16）是最常见的病原体。超过80%的手足口病病例是由这两类病毒导致的。
肠道病毒传播途径
通过密切接触传播： 病毒可通过直接接触患者的唾液、疱疹液或粪便传播。比如，与患病儿童共用餐具、毛巾、玩具等都可能被感染。经呼吸道飞沫传播： 患者咳嗽、打喷嚏时产生的飞沫中含有病毒，其他人吸入这些飞沫就有可能被感染，一般在近距离接触时较易发生这种传播方式。
易感人群特点
儿童是高发人群： 尤其是5岁以下儿童更容易感染手足口病。因为儿童的免疫系统还不完善，对肠道病毒的抵抗力相对较弱。据统计，手足口病患者中5岁以下儿童占比超过90%。免疫力低下人群易感染： 除了儿童，免疫力低下的成人也可能被感染，但相对儿童来说发病率较低。比如患有某些基础疾病、长期使用免疫抑制剂的人，感染风险会增加。
环境卫生因素影响
卫生条件差易引发： 在卫生条件较差的环境中，肠道病毒更容易存活和传播。比如一些卫生设施不完善的幼儿园、学校等场所，儿童集中，一旦有病例出现，就容易造成疾病的传播流行。污染的环境增加风险： 被病毒污染的水源、土壤等环境因素，也可能间接导致手足口病的传播。例如，被患者粪便污染的水源被其他儿童接触后，就可能感染病毒。