跖疣主要是由人类乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV - 1、HPV - 2等型别。一般来说，皮肤有破损时，接触到HPV就容易感染从而得跖疣。
一、直接接触感染因素
皮肤破损是关键：当足部皮肤出现微小破损，比如走路磨出的小伤口、不经意的擦伤等，这时候如果接触到了携带HPV的物体，就很容易被感染。比如在公共浴室、游泳池等公共场所，地面或者设施上可能残留有HPV病毒，一旦足部皮肤有破损，就给了HPV可乘之机。自身接种传播：患者自己的身体其他部位如果有HPV感染的疣，比如手上的寻常疣，用手触摸了手上的疣之后再去触碰足部，就可能把HPV带到足部，导致足部感染HPV引发跖疣。而且跖疣长在脚上，走路等活动可能会让疣体处的病毒传播到周围皮肤，造成更多部位感染。
二、自身免疫力因素
免疫力低下人群易患：当人体免疫力比较低的时候，比如长期熬夜、过度劳累、患有某些慢性疾病（像糖尿病等）或者正在接受免疫抑制治疗的人，身体对HPV的抵御能力下降，就更容易感染HPV从而患上跖疣。例如，长期熬夜的人，身体的免疫系统功能会受到影响，这时候感染HPV的风险就会增加。儿童和青少年相对高发：儿童和青少年的免疫系统还在发育阶段，相对成年人来说免疫力更弱一些，所以他们感染HPV引发跖疣的几率相对较高。比如在学校等集体环境中，儿童之间接触频繁，更容易相互传播HPV，导致跖疣在儿童群体中时有发生。
三、环境因素影响
潮湿环境利于病毒存活：跖疣在潮湿的环境中更容易生存和传播。像长期穿不透气的鞋子，脚部一直处于潮湿闷热的状态，这样的环境就为HPV的存活和感染提供了便利条件。比如有些人喜欢穿运动鞋，但是如果鞋子不透气，脚部出汗后不能及时散发，就容易滋生HPV，增加得跖疣的可能性。公共环境的病毒传播：在一些卫生条件较差的公共环境中，HPV病毒存活时间相对较长。比如公共厕所的地面、公共浴室的拖鞋等，如果被HPV污染，其他人接触后就容易感染。据统计，在公共浴室感染跖疣的几率比在干净卫生的私人环境中要高不少。