咳嗽时肚子两边疼可能由生理因素、支气管炎、胸膜炎等引起。具体如下：
一、生理因素：患者咳嗽时会牵扯腹部肌肉，从而反射性地出现肚子两边疼，这是咳嗽时的常见现象。可遵医嘱使用氢溴酸右美沙芬片、枸橼酸喷托维林片、阿莫西林胶囊等药物来缓解咳嗽症状，当咳嗽症状消除后，腹痛也会随之消失。在此期间，患者需要多休息，避免过度劳累。
1.氢溴酸右美沙芬片：可抑制延脑咳嗽中枢而产生镇咳作用。
2.枸橼酸喷托维林片：对咳嗽中枢有选择性抑制作用。
3.阿莫西林胶囊：具有抗菌作用。
二、支气管炎：由于患者咳嗽幅度较大，可能会明显牵拉腹部肌肉。会出现咳嗽时肚子两边疼、嗓子肿胀等症状，还可能伴有全身无力、喉咙发痒等表现。可遵医嘱服用盐酸氨溴索口服溶液、罗红霉素分散片、头孢克洛分散片等药物。日常要注意饮食清淡，避免食用辛辣刺激性食物。
1.盐酸氨溴索口服溶液：可降低痰液黏度，促进痰液排出。
2.罗红霉素分散片：属于抗生素，可用于抗炎治疗。
3.头孢克洛分散片：也是一种抗生素。
三、胸膜炎：因咳嗽时胸膜腔炎症累及膈肌导致。在咳嗽时会出现肚子两边疼、低热、盗汗等症状，同时还可能伴有胸闷气短、胸壁疼痛、局部疼痛等情况。可遵医嘱服用乙酰半胱氨酸泡腾片、头孢克洛分散片、阿司匹林肠溶片等药物。平时要鼓励患者积极排痰，保持呼吸道通畅。
1.乙酰半胱氨酸泡腾片：有祛痰作用。
2.头孢克洛分散片：起到抗菌消炎的功效。
3.阿司匹林肠溶片：可用于抗炎、镇痛、解热。
总之，当出现咳嗽时肚子两边疼的情况时，要及时就医，明确具体原因，并在医生的指导下进行针对性治疗。同时，在治疗过程中要注意休息、合理饮食，以促进身体的恢复。