睾丸扭转主要是由于睾丸和精索的位置发生异常改变，导致睾丸血液供应受阻引起的。一般来说，先天性解剖异常是一个重要原因，比如睾丸引带过长、睾丸鞘膜囊过大等情况，会使得睾丸活动度增大，容易发生扭转，这种情况在青少年中相对常见。
解剖结构异常因素
睾丸引带异常： 正常情况下睾丸引带对睾丸有固定作用，但如果睾丸引带过长，就会让睾丸在阴囊内的位置不稳定，增加扭转的风险。据统计，有部分睾丸扭转患者存在睾丸引带过长的情况。鞘膜囊异常： 正常的鞘膜囊能较好地固定睾丸位置，然而当鞘膜囊过大时，睾丸在里面活动空间增大，也容易发生扭转。比如有些男性天生鞘膜囊发育异常，就比其他人更易出现睾丸扭转问题。
外力因素影响
剧烈运动： 剧烈运动时，阴囊会受到晃动等外力影响，尤其是突然的剧烈运动，像突然的奔跑、跳跃等，可能会导致睾丸和精索发生扭转。例如一些爱好运动的青少年，在进行激烈体育活动过程中就可能引发睾丸扭转。外力撞击： 阴囊部位受到外力撞击，也可能引发睾丸扭转。比如在运动中被他人碰撞到阴囊，或者意外摔倒时阴囊部位受到撞击，都有可能导致睾丸位置改变，进而发生扭转。
其他潜在因素
睡眠姿势： 睡眠时的不良姿势也可能成为诱因。比如长时间侧卧，一侧睾丸长时间受到压迫，并且姿势的改变可能导致精索扭转，从而引发睾丸扭转。有研究发现，部分患者是在睡眠中因为姿势变化而出现睾丸扭转的情况。疾病影响： 某些疾病也可能增加睾丸扭转的发生几率。比如附睾炎、睾丸炎等疾病，会引起阴囊内组织充血、水肿，使得睾丸与精索的相对位置发生改变，容易诱发睾丸扭转。