儿童扁桃体肥大的治疗需根据具体情况而定。一般来说，轻度的扁桃体肥大可以先通过保守治疗观察，中重度且影响呼吸、吞咽等情况可能需要手术治疗。
保守治疗方式
观察等待：
对于一些轻度的扁桃体肥大，没有明显的临床症状，比如不影响呼吸、睡眠，也没有反复的扁桃体发炎等情况，可以选择观察等待。但要注意观察孩子的呼吸、吞咽等情况，定期带孩子到医院复诊，一般每3 - 6个月复查一次，观察扁桃体肥大是否有进展等情况。
药物治疗：
如果扁桃体肥大是由炎症引起的，如细菌感染导致的扁桃体炎引发的扁桃体肥大，可以使用抗生素治疗。常用的抗生素有青霉素类，如阿莫西林等。但使用抗生素需要在医生的指导下进行，要根据孩子的年龄、体重等因素来选择合适的药物及剂量。不过药物治疗主要是针对炎症，不一定能使扁桃体肥大完全消退，但可以缓解因炎症导致的相关症状。比如如果是病毒感染引起的扁桃体炎导致的肥大，一般以对症治疗为主，可使用一些缓解咽痛等症状的药物，如小儿咽扁颗粒等，但这类药物主要是缓解症状，不能直接使扁桃体肥大缩小。
手术治疗情况
手术指征：
当扁桃体肥大导致孩子出现睡眠呼吸暂停、反复的扁桃体化脓性感染（一年发作7 - 8次及以上）、影响吞咽和发音等情况时，就需要考虑手术治疗。一般来说，孩子年龄在4岁以上，身体状况良好，没有手术禁忌证时可以考虑行扁桃体切除术。手术方式有传统的扁桃体剥离术等。
术后注意事项：
手术后孩子需要注意休息，饮食上要吃温凉的流质或半流质食物，如牛奶、粥等，避免吃辛辣、刺激性食物以及过硬的食物，防止刺激手术创面引起出血等情况。同时要按照医生的要求按时服用抗生素等药物，预防感染，一般术后需要住院观察2 - 3天，密切观察创面情况以及孩子的体温、出血等情况。
日常护理要点
口腔卫生：
要让孩子养成良好的口腔卫生习惯，每天早晚刷牙，饭后漱口。可以使用儿童专用的牙膏和牙刷，保持口腔清洁，减少细菌滋生，降低扁桃体发炎的几率，从而间接对扁桃体肥大的情况产生影响。比如每天早晚用软毛牙刷，按照正确的刷牙方法刷牙，每次刷牙时间不少于2分钟。
增强免疫力：
让孩子适当进行体育锻炼，如每天进行30分钟左右的户外活动，像散步、跑步等，增强体质。同时要保证孩子有充足的睡眠，一般学龄前儿童每天需要睡眠11 - 13小时，学龄儿童每天需要睡眠10 - 11小时，良好的睡眠和运动有助于提高孩子的免疫力，减少扁桃体发炎的发生，对扁桃体肥大的控制有一定帮助。