哺乳期月经来了两个月又停了，可能与怀孕、激素水平未恢复、内分泌失调等有关。具体如下：
一、怀孕：对于有性生活的哺乳期女性，必须排除怀孕的可能。因为哺乳期可能会排卵，若未采取避孕措施，就可能导致怀孕，进而出现月经不来潮的情况，可通过查血HCG或尿HCG来明确诊断。
1.怀孕的原理：哺乳期女性可能有排卵现象，性生活后精卵结合可致怀孕。
2.怀孕对月经的影响：怀孕后子宫内膜会为孕育胎儿做准备，不再周期性脱落，从而导致月经停止。
二、激素水平未恢复：在哺乳期间，可能由于下丘脑-垂体-卵巢轴尚未完全恢复，导致排卵不规律，引起月经紊乱。
1.激素轴的作用：下丘脑-垂体-卵巢轴对女性的生殖内分泌起着重要调节作用。
2.未恢复的表现：使排卵不正常，进而影响月经的规律性。
三、内分泌失调：如果女性在哺乳期压力过大或过于劳累，可能引发内分泌失调，导致激素水平紊乱而使月经异常，这种情况一般属于正常，无需过度担心。
1.压力等因素的影响：过大的压力和过度劳累可扰乱体内激素平衡。
2.对月经的后果：造成月经的不正常。
此外，如果哺乳时间特别长，比如大于1年甚至2年，有可能出现高泌乳素血症等疾病，从而引起这种情况，此时需要进行核磁检查以判断是否有垂体微腺瘤。若有高泌乳素血症，则为病理情况，需要给予药物治疗或手术治疗。
总结提示：哺乳期月经异常的原因多样，主要包括怀孕、激素水平未恢复、内分泌失调等，还可能与哺乳时间长引发的疾病有关，应根据具体情况进行分析和诊断。