哺乳期月经来了两个月又停了，这可能与怀孕、激素水平未恢复、内分泌失调等有关。哺乳期是较为特殊的生理时期，可能导致部分女性排卵不规律，具体情况如下。
一、怀孕：对于有性生活的哺乳期女性，要排除怀孕可能。因为哺乳期可能会排卵，若未采取避孕措施，就可能怀孕而致月经不来潮，可通过查血HCG或尿HCG来明确诊断。
二、激素水平未恢复：哺乳期间，可能因下丘脑-垂体-卵巢轴未完全恢复，导致无规律排卵，进而引起月经紊乱。
三、内分泌失调：女性哺乳期若压力过大或过于劳累，可能引发内分泌失调，造成激素水平紊乱，从而导致月经异常，这种情况一般正常，无需担忧。
此外，如果哺乳时间特别长，如大于1年甚至2年，可能出现高泌乳素血症等疾病，进而出现这种状况。此时需要进行核磁检查，以判断是否有垂体微腺瘤。若有高泌乳素血症，则为病理情况，需要给予药物治疗或手术治疗。
总之，哺乳期月经出现异常要综合考虑多种因素，必要时及时就医检查以明确原因。