小孩睡着后咳嗽的原因包括肠胃中食物未消化完、食道反流、过敏等。
一、肠胃中的食物没有消化完：如果在晚上睡觉前孩子吃的食物较多，或者常让孩子进食生冷、油腻、难以消化的食物，就容易导致睡前胃内的食物持续不能完全消化。这样会使食管腔内压力升高，进而压迫气管和咽喉部位，从而引起刺激性咳嗽。这种情况下通常不需要专门治疗，只需注意睡前避免让孩子食用过多食物即可。
二、食道反流：宝宝平躺睡觉后，胃内食物可能会向食道反流，反流物刺激咽喉部位就会产生咳嗽现象。一般可以使用奥美拉唑、泮托拉唑等药物进行治疗。
三、过敏：如果孩子属于过敏体质，在睡觉后，房间内如熏蚊香的烟味、某些香水的特殊气味等，都可能引发孩子出现过敏症状。此时孩子有可能出现咽喉部位瘙痒的情况，进而诱发咳嗽。通常可以使用西替利嗪、氯雷他定等药物进行治疗。
总之，小孩睡着后咳嗽可能是由多种原因引起的，家长需要根据具体情况进行判断和处理，必要时寻求医生的帮助。