早上起来咳嗽有黄痰，可能由支气管炎、肺炎、肺脓肿等疾病引发。
一、支气管炎：这是由于生物、理化刺激或过敏等各类因素致使气管、支气管黏膜及其周围组织出现炎症。其典型症状就是咳嗽、咳痰，开始时痰量较少，之后会逐渐增多，且可能会持续2至3周。通常痰液是白色黏痰，若合并细菌感染，比如铜绿假单胞菌感染，痰液颜色就会发生改变，呈现黄绿色。
二、肺炎：指的是终末气道、肺泡和肺间质的炎症。可由病原微生物、物理化学因素、免疫损伤、过敏以及药物等导致，症状变化幅度较大，可轻可重，具体取决于病因与身体状况。咳痰往往在咳嗽出现后产生，起初表现为痰液增多，多为白色黏液痰，要是合并铜绿假单胞菌感染，痰液颜色会转变为黄绿色。
三、肺脓肿：是一种或多种病原体引起的肺部化脓性病症，痰液可以是黏液痰、黏液脓痰，若是由铜绿假单胞菌感染引发，痰液颜色会变为黄绿色。
若患者早上起来有咳嗽且伴有黄痰的情况，建议患者不必过度紧张焦虑，应及时就诊，完善相关检查以明确诊断，并积极进行治疗。
总结概况提示：主要阐述了早上咳嗽有黄痰可能的疾病原因，包括支气管炎、肺炎、肺脓肿等，分别对它们的特点和相关症状表现进行了详细说明，强调出现这种情况应及时就医检查和治疗。