关键点：同房时阴茎疼痛原因包括男女配合不好、姿势不正确，男性患者有阴茎海绵体硬结症、尿道炎、包皮龟头炎等，需及时就医查明原因，根据不同情况选择处理方式。
一、男女配合不好、姿势不正确
性生活中男女配合不佳，比如女性阴道分泌液体不足致阴道干涩，或姿势不当，都可能导致阴茎疼痛。这种情况需要性伴侣间加强沟通与配合，共同探索适合的性爱姿势。初期可尝试使用避孕套等情趣用品来增加阴道润滑度。
二、男性合并阴茎海绵体硬结症
男性患有海绵体硬结症时，即阴茎海绵体出现纤维样斑块，部分患者阴茎勃起时会疼痛，且能在阴茎海绵体摸到硬块，有的还可能伴有阴茎勃起弯曲等情况。可通过阴茎B超检查来诊断，治疗通常以保守药物治疗为主，对病情严重且阴茎硬结稳定的患者，可考虑手术切除斑块。
三、男性尿道炎
男性患者若有尿道炎，性生活时会出现阴茎疼痛，此时需要及时完善尿常规、微生物培养及药敏等检查，然后采用敏感抗生素进行治疗，同时应避免性生活，且最好夫妻同治，以防交叉感染。
四、包皮龟头炎
男性患者若有细菌性、真菌性包皮龟头炎，性生活时会有阴茎疼痛，同时伴有包皮异常分泌物等。需要外用红霉素软膏、酮康唑软膏等抗菌药物处理，治疗期间夫妻双方应进行保护性性生活，且夫妻同治。
总结概况提示：同房阴茎疼痛的原因多样，明确具体原因并采取针对性处理措施很关键，涉及到性技巧的改善、疾病的诊断与治疗等，夫妻双方均应予以重视和配合。