萎缩性胃炎的治疗药物需根据具体情况选择，一般常用药物包括抑酸剂、胃黏膜保护剂等。例如，质子泵抑制剂是常用的抑酸剂，像奥美拉唑，能有效抑制胃酸分泌，缓解因胃酸过多引起的不适，一般疗程可能需要4~8周左右。
抑酸剂类药物
质子泵抑制剂：这类药物能强力抑制胃酸分泌，常见的有奥美拉唑、兰索拉唑等。它们通过特异性地作用于胃黏膜壁细胞，阻断胃酸分泌过程中的关键酶，从而减少胃酸分泌。一般适用于胃酸分泌过多导致胃痛、反酸等症状明显的萎缩性胃炎患者。H₂受体拮抗剂：如雷尼替丁、法莫替丁等，也是抑制胃酸的药物。它通过竞争胃壁细胞上的H₂受体，减少胃酸分泌。其抑酸作用相对质子泵抑制剂稍弱，但对于一些轻中度胃酸分泌增多的萎缩性胃炎患者也有一定疗效。
胃黏膜保护剂类药物
铋剂：像枸橼酸铋钾，它可以在胃黏膜表面形成一层保护膜，覆盖受损的黏膜，促进黏膜修复。同时，铋剂还有一定的杀灭幽门螺杆菌的作用，对于伴有幽门螺杆菌感染的萎缩性胃炎患者较为适用。一般服用后可能会出现舌苔和大便发黑的情况，这是正常现象，不用过于紧张。铝碳酸镁：能中和胃酸，还可以吸附胆汁，保护胃黏膜免受胆汁等物质的损伤。它起效较快，服用后能迅速缓解胃痛、烧心等症状，对于有胆汁反流的萎缩性胃炎患者效果较好。
促进胃动力类药物
多潘立酮：可以促进胃蠕动，加快胃排空，缓解腹胀、早饱等症状。适用于萎缩性胃炎伴有消化不良，出现胃胀、恶心等胃动力不足表现的患者。但需要注意，心脏病患者等要在医生指导下使用，因为多潘立酮可能会有一些心血管方面的潜在风险。莫沙必利：也是促进胃动力的药物，作用机制与多潘立酮类似，但对心血管系统的影响相对较小。它能增强胃肠道的蠕动，改善消化不良症状，对于萎缩性胃炎导致的胃肠功能紊乱有一定的治疗作用。