表层巩膜炎的引起原因较为复杂，可能与多种因素相关。一般来说，免疫因素是常见的诱因之一，比如自身免疫性疾病患者相对更容易出现表层巩膜炎。另外，感染因素也可能导致，像病毒感染等有一定可能引发该病。还有一些环境因素也可能起到作用，比如长期处于污染环境或接触某些刺激性物质等。
免疫因素相关
自身免疫性疾病关联： 患有类风湿关节炎等自身免疫性疾病的人群，机体免疫系统出现异常，容易攻击自身组织，包括眼部的表层巩膜组织，从而增加表层巩膜炎的发病风险。这类患者中约有一定比例会并发表层巩膜炎，但具体比例因不同自身免疫性疾病而有所差异。免疫系统异常表现： 当免疫系统失衡时，会产生一些异常的免疫反应物质，这些物质可能会对表层巩膜的组织造成损伤，引发炎症反应，导致表层巩膜炎的发生。
感染因素相关
病毒感染影响： 某些病毒感染，例如单纯疱疹病毒感染，有可能诱发表层巩膜炎。当人体感染这类病毒后，病毒在体内引发免疫反应，进而波及眼部的表层巩膜，引起炎症。有研究发现，约10% - 15%的表层巩膜炎患者有过近期病毒感染的经历。细菌感染关联： 一些细菌感染也可能与表层巩膜炎的发生有关，但相对病毒感染来说，比例稍低。比如葡萄球菌等细菌感染眼部周围组织后，可能蔓延至表层巩膜引发炎症。
环境因素相关
污染环境影响： 长期处于空气污染严重的环境中，空气中的有害物质会刺激眼部，包括表层巩膜，增加表层巩膜炎的发病几率。例如在工业污染较为严重的地区，表层巩膜炎的发病率可能会比污染较轻地区高一些。刺激性物质接触： 经常接触一些刺激性化学物质，像化妆品中的某些成分、清洁剂等，如果眼部接触到这些刺激性物质，可能会损伤表层巩膜的组织，引发炎症反应，导致表层巩膜炎。比如长期接触染发剂的人群，眼部接触到染发剂成分后，就有可能诱发该病。