孕酮低可能导致女性出现褐色分泌物，具体情况需依据妊娠期与非妊娠期来判断。
一、妊娠期孕酮低的影响：
1.可能严重影响胚胎生长发育，部分孕妇会出现胚胎生长发育迟缓、胚胎停止等状况，甚至引发先兆流产，进而有阴道流血现象，若流血量少，血液与分泌物混合便呈现褐色分泌物表现。
2.治疗上需使用黄体酮软胶囊、地屈孕酮等孕激素类药物，同时要注意休息，避免剧烈运动，必要时卧床，保持乐观舒畅心情，避免过于激动，还需定期做好各项孕期检查。
二、非妊娠期孕酮低的影响：
1.会对子宫内膜产生严重影响，导致撤退性出血，表现为不规则阴道流血，血液混入分泌物中就会出现褐色分泌物。
2.可根据病情在医生指导下使用孕激素类药物治疗，以有效改善病情。
总之，孕酮低时要根据具体处于妊娠期还是非妊娠期来准确判断病情及影响，并采取相应的治疗措施，以保障女性健康。