上呼吸道感染多数由病毒引起，一般不需要使用抗菌药物，对症治疗即可。通常70%~80%由病毒导致的上呼吸道感染，靠自身免疫力7~10天可自愈。
对症治疗药物选择
解热镇痛药：
对乙酰氨基酚： 适用于成人及12岁以上儿童，能缓解发热、头痛、肌肉酸痛等症状，常规剂量下较为安全，但过量使用可能损伤肝脏，需严格按说明书或医嘱服用。布洛芬： 6个月以上儿童及成人可使用，除退热外，还能减轻炎症导致的疼痛，抗炎作用相对较强，部分人服用后可能出现胃肠道不适，如恶心、呕吐等。
减轻鼻充血药物：
伪麻黄碱： 可收缩鼻黏膜血管，减轻鼻塞症状，常用制剂有复方氨酚烷胺胶囊等，但高血压、心脏病患者需慎用，因为可能引起血压升高、心跳加快等不良反应。赛洛唑啉： 鼻用制剂能快速缓解鼻塞，但连续使用一般不宜超过7天，长期使用可能导致药物性鼻炎，使鼻塞症状更难缓解。
抗病毒药物应用
对于流感病毒引起的上呼吸道感染，在发病48小时内使用抗流感病毒药物可减轻症状、缩短病程。奥司他韦： 成人及1岁以上儿童均可使用，能抑制流感病毒神经氨酸酶活性，阻止病毒释放，从而发挥抗病毒作用，但使用时需注意可能出现恶心、呕吐等胃肠道反应，对药物成分过敏者禁用。
中药治疗
银翘解毒片： 具有辛凉解表、清热解毒的作用，适用于风热感冒导致的发热、头痛、咳嗽、口干、咽喉疼痛等症状，孕妇慎用，服药期间不宜同时服用滋补性中药。连花清瘟胶囊： 可清瘟解毒、宣肺泄热，对于流行性感冒属热毒袭肺证有一定疗效，部分人服用后可能出现胃肠道不适，如腹泻等，风寒感冒者不适用。