上呼吸道病毒感染通常没有绝对首选的特定药物，一般以对症治疗为主。比如普通感冒引起的上呼吸道病毒感染，常用的缓解症状药物有对乙酰氨基酚等，一般服用后能在一定时间内缓解发热、头痛等症状。
对症治疗药物选择
退热止痛类：对乙酰氨基酚可用于缓解上呼吸道病毒感染引起的发热、头痛、肌肉酸痛等症状，成人及12岁以上儿童常用剂量下相对安全，但3岁以下幼儿使用需谨慎，要严格按照体重等计算合适剂量。减轻鼻塞类：伪麻黄碱可以减轻鼻黏膜充血，缓解鼻塞症状，但有高血压、心脏病等基础疾病的患者使用时需咨询医生，因为可能会对血压等产生影响。
抗病毒药物的应用情况
常用抗病毒药：对于流感病毒引起的上呼吸道感染，奥司他韦是较为常用的抗病毒药物，它能抑制流感病毒的神经氨酸酶活性，从而阻止病毒释放，一般在流感症状出现后的48小时内使用效果较好，但它也有一些禁忌，如对奥司他韦过敏者禁用。不过，并非所有上呼吸道病毒感染都需要使用抗病毒药物，普通的鼻病毒等引起的上呼吸道感染，通常不需要常规使用抗病毒药物，主要还是以对症治疗为主。
儿童特殊情况
儿童用药注意：儿童上呼吸道病毒感染时，用药更要谨慎。像含布洛芬的药物，6个月以下婴儿使用需遵医嘱，因为婴儿的肝肾功能发育还不完善，药物代谢能力较弱。儿童使用对乙酰氨基酚时，要根据体重精确计算剂量，不能超量使用，以免引起不良反应。而且儿童用药最好选择儿童专用的剂型，如儿童退烧药混悬液等，方便准确给药。
非药物辅助措施
休息与饮水：上呼吸道病毒感染后，充足的休息很重要，一般建议患者保证每天7 - 8小时以上的睡眠时间，让身体有足够的能量来对抗病毒。同时，要多喝水，每天饮水量建议在1500 - 2000毫升左右，有助于稀释痰液，促进新陈代谢，帮助身体恢复。饮食调整：饮食上要注意清淡、易消化，多吃富含维生素的蔬菜水果，如橙子、菠菜等，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，这些食物可能会加重呼吸道黏膜的刺激，不利于病情恢复。