滴虫性尿道炎主要通过药物治疗，一般使用甲硝唑等硝基咪唑类药物效果较好。通常规范用药后可取得较好疗效，但需注意相关事项。
药物选择要点
甲硝唑： 是治疗滴虫性尿道炎的常用药物，它能阻碍滴虫的核酸合成，从而抑制其生长繁殖。一般采用口服给药的方式。替硝唑： 也可用于滴虫性尿道炎的治疗，其抗菌谱与甲硝唑相似，对滴虫有较好的抑制作用，同样是口服使用。
治疗中的注意事项
性伴侣同步治疗： 滴虫性尿道炎可通过性接触传播，所以患者的性伴侣也需要同时接受治疗，否则容易出现交叉感染，导致病情反复。一般建议性伴侣一起口服甲硝唑类药物进行预防和治疗。治疗期间避免性生活： 在治疗滴虫性尿道炎期间，应避免性生活，以免影响治疗效果，还可能将滴虫传染给对方。治疗结束后，需复查滴虫阴性，再恢复正常性生活。
特殊人群的处理
孕妇： 孕妇患滴虫性尿道炎时用药需谨慎，一般不建议首选甲硝唑口服，可在医生评估后考虑局部使用甲硝唑制剂，但要严格遵循医生的指导，因为孕妇使用不当可能会对胎儿产生影响。哺乳期女性： 哺乳期女性使用甲硝唑时，药物可能会通过乳汁传递给婴儿，所以一般建议暂停哺乳，待停药一段时间后再恢复哺乳，具体停药和恢复哺乳的时间需咨询医生。
治疗后的复查
复查时间： 在完成一个疗程的治疗后，一般建议在下次月经干净后复查阴道分泌物，查看是否还存在滴虫。通常需要连续复查2 - 3次，结果均为阴性才算临床治愈。如果复查仍有滴虫，可能需要调整治疗方案。