滴虫性尿道炎主要通过药物治疗，通常可以选用甲硝唑等药物。一般来说，规范用药后能取得较好疗效。
药物选择要点
甲硝唑： 是治疗滴虫性尿道炎的常用药物，它能抑制滴虫的氧化还原反应，使虫体氮链断裂，从而发挥杀灭滴虫的作用。替硝唑： 也可用于治疗滴虫性尿道炎，其抗菌谱与甲硝唑相似，对滴虫的作用较为显著。
生活护理注意
个人卫生： 患者要保持外阴清洁干燥，每天用温水清洗外阴，勤换内裤，内裤最好经过暴晒消毒。避免性生活： 在治疗期间应避免性生活，因为滴虫性尿道炎可通过性接触传播，防止交叉感染，性伴侣也需同时接受检查和治疗。
特殊人群注意
孕妇： 孕妇患滴虫性尿道炎时用药需谨慎，应在医生指导下选择相对安全的药物，因为某些药物可能对胎儿产生影响。免疫力低下者： 如糖尿病患者等免疫力低下人群，除了积极治疗尿道炎外，还需控制基础疾病，提高自身免疫力，这样有助于病情的恢复，并且能减少复发的可能。