男性双肾结石的症状表现多样，常见的有腰部疼痛，约半数患者会出现腰部隐痛或胀痛，活动后疼痛可能加重。还有血尿，肉眼可见的血尿较少，多数是镜下血尿，通过尿常规检查可发现红细胞。另外，可能出现排尿异常，如尿频、尿急、尿痛等，这是因为结石刺激尿路黏膜导致。
腰部疼痛情况
隐痛或胀痛： 双肾结石时，结石在肾脏内移动或刺激肾盂、输尿管，容易引起腰部不同程度的隐痛或胀痛，这种疼痛可能会持续存在或间歇性发作。比如一些患者会感觉腰部有持续的不适感，活动后比如走路、弯腰等，疼痛可能会比休息时更明显。疼痛放射： 有的患者疼痛会放射到下腹部、腹股沟等部位，男性可能会感觉疼痛向阴囊部位放射，这是因为输尿管走行的神经支配有交叉。
血尿的具体表现
镜下血尿为主： 大部分男性双肾结石患者的血尿是镜下血尿，也就是通过显微镜检查尿液才能发现红细胞。只有少数严重的情况会出现肉眼可见的血尿，尿液颜色像洗肉水一样。而且血尿的出现通常与结石活动有关，当结石移动擦伤肾盂、输尿管黏膜时，就容易引起出血导致血尿。
排尿异常状况
尿频尿急： 结石刺激尿路黏膜，会导致膀胱频繁产生尿意，出现尿频症状，同时可能伴有尿急，即突然有强烈的排尿欲望，很难控制。例如有的患者一小时可能要跑好几趟厕所，而且刚有尿意就得赶紧去厕所，不然就会尿裤子。尿痛表现： 排尿时会感觉尿道有刺痛感，这是因为结石在尿道内移动或刺激尿道黏膜，导致排尿过程中出现疼痛，疼痛程度因人而异，有的较轻，有的较为剧烈。