卵巢早衰是指女性40岁前出现卵巢功能减退，其病因较为复杂。据统计，约10% - 20%的卵巢早衰与遗传因素相关。
遗传因素导致
染色体异常： 比如X染色体异常，像特纳综合征患者就常伴有卵巢早衰。这类患者的染色体核型多为45，XO及其变异型，由于染色体异常，影响卵巢正常发育和功能。基因突变： 某些特定基因的突变也可能引发卵巢早衰。例如FOXL2基因的突变，会干扰卵巢细胞的正常功能，导致卵巢过早衰退。
自身免疫因素影响
免疫系统攻击卵巢： 身体的免疫系统错误地将卵巢组织当作外来异物进行攻击。像患有自身免疫性甲状腺疾病的女性，发生卵巢早衰的风险相对较高。因为自身免疫性甲状腺疾病患者的免疫系统会产生针对甲状腺的抗体，同时可能也会对卵巢组织产生影响。其他自身免疫性疾病： 像红斑狼疮等自身免疫性疾病，也可能累及卵巢，导致卵巢功能受损，引发卵巢早衰。
医源性因素所致
手术影响： 比如卵巢切除术，若因疾病等原因进行了双侧卵巢切除，必然会导致卵巢功能丧失，引发卵巢早衰。另外，盆腔的恶性肿瘤手术，如宫颈癌根治术等，在切除肿瘤的过程中可能会损伤卵巢的血液供应或组织，从而影响卵巢功能。放疗化疗影响： 某些女性因患恶性肿瘤接受化疗时，化疗药物可能会破坏卵巢内的卵泡，导致卵泡大量丢失。一般来说，年龄较轻的女性在接受大剂量化疗后，发生卵巢早衰的几率相对更高。放疗也可能会损伤卵巢组织，影响卵巢功能，尤其是盆腔部位的放疗，对卵巢的影响较为明显。