性交疼痛的原因有多种。比如生殖系统器质性病变，像女性的外阴炎、阴道炎，据统计，大约有10% - 20%的女性因阴道炎会出现性交疼痛情况；男性的包皮过长、包茎也可能导致性交时疼痛。另外，心理因素也是常见原因，比如长期的焦虑、抑郁情绪，大约有30%左右的性交疼痛患者存在心理方面的诱因，像新婚夫妇由于紧张、缺乏性知识等心理因素可能引发性交疼痛。还有内分泌因素，女性绝经后雌激素水平降低，阴道黏膜变薄、干涩，大约50%以上的绝经后女性会因雌激素缺乏出现性交疼痛；男性雄激素水平下降也可能影响性功能，导致性交时不适。
生殖系统器质性病变相关
女性外阴炎： 外阴炎会使外阴皮肤黏膜充血、肿胀，性交时摩擦刺激会加重疼痛，患者能明显感觉到外阴部位的不适，检查时可见外阴皮肤有红斑、丘疹等改变。女性阴道炎： 不同类型的阴道炎表现不同，如霉菌性阴道炎会让阴道分泌物增多且呈豆腐渣样，刺激阴道黏膜，性交时疼痛明显；滴虫性阴道炎会导致阴道黏膜充血，性交时疼痛加剧，通过白带常规检查可明确诊断。男性包皮过长： 包皮过长时，包皮覆盖龟头，性交时包皮上翻可能会卡住，引起疼痛，还可能导致局部感染，反复炎症刺激会加重疼痛情况。男性包茎： 包茎是包皮口狭窄，无法上翻露出龟头，性交时会因阴茎勃起受到限制而产生疼痛，严重的包茎还可能影响排尿等功能。
心理因素相关
新婚夫妇心理因素： 新婚夫妻往往缺乏性知识，对性交充满紧张、恐惧情绪，这种心理状态会导致阴道肌肉痉挛，从而引发性交疼痛，一般随着夫妻逐渐熟悉性过程，心理放松后疼痛会有所缓解，但如果长期心理压力大，可能会持续存在。长期焦虑抑郁人群： 长期处于焦虑、抑郁状态的人，神经系统功能紊乱，会影响性功能相关的神经调节，导致性交时出现疼痛，这类患者需要进行心理疏导，必要时可能需要配合心理治疗药物辅助改善心理状态。
内分泌因素相关
女性绝经后雌激素缺乏： 绝经后女性雌激素水平急剧下降，阴道黏膜变薄、弹性降低、分泌物减少，变得干涩，性交时就容易产生疼痛，可通过补充雌激素来改善阴道环境，比如局部使用雌激素乳膏等，但需要在医生评估后使用，因为雌激素补充有一定的禁忌证和风险。男性雄激素水平下降： 随着年龄增长，男性雄激素水平会逐渐降低，可能出现性欲减退、勃起功能障碍等情况，也可能在性交时感觉不适，出现疼痛，可通过检测雄激素水平，在医生指导下考虑是否进行雄激素补充治疗，但要注意评估风险。