泌尿系统感染通常是由细菌等病原体入侵引起的，其中大肠杆菌是最常见的致病菌，约80%的泌尿系统感染由它导致。
致病菌入侵途径
上行感染： 这是最主要的感染途径。细菌从尿道口进入，沿着尿道上行，经过膀胱、输尿管，甚至到达肾脏。比如女性的尿道短而直，长度约3~5厘米，相比男性更容易让细菌上行感染，尤其是性生活后，细菌更易侵入尿道引发感染。血行感染： 身体其他部位的感染病灶，细菌可通过血液循环到达泌尿系统引起感染。例如皮肤感染、疖肿、扁桃体炎等，细菌随着血液流动到肾脏等泌尿系统部位引发感染，但这种情况相对少见。
易感因素
机体免疫力下降： 当人体抵抗力降低时，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病，或者长期使用免疫抑制剂，身体抵御细菌的能力减弱，就容易发生泌尿系统感染。老年人由于机体功能衰退，免疫力也相对较低，也是泌尿系统感染的高发人群。尿路梗阻： 如尿路结石、前列腺增生等疾病会导致尿液排出不畅，尿液在尿路中停留，为细菌的生长繁殖提供了良好的环境，细菌容易大量繁殖引发感染。据统计，约50%的尿路梗阻患者会并发泌尿系统感染。泌尿系统结构异常： 像先天性尿路畸形，如肾盂输尿管连接处狭窄等，会使尿液引流不畅，增加感染的风险。另外，留置导尿管等医疗器械操作，破坏了尿路的自然防御屏障，也容易让细菌侵入引发感染，尤其是留置导尿管超过3天的患者，泌尿系统感染的发生率会大幅增加，可达90%以上。