呼吸暂停综合征主要有睡眠中的典型症状、白天的相关表现以及可能伴随的其他症状。一般来说，中重度呼吸暂停综合征患者每小时呼吸暂停和低通气发作次数通常大于15次。
睡眠中的典型症状
夜间打鼾且呼吸暂停： 患者夜间睡眠时会出现响亮且不规律的打鼾声，还会有呼吸暂停现象，有时能观察到患者突然憋气，然后猛地喘气。比如有的患者打鼾声音很大，突然就没了呼吸，停顿几秒后又剧烈喘气。夜间频繁翻身、肢体动作多： 由于呼吸不畅，患者会在睡眠中频繁翻身，变换睡姿，有的还会有肢体不自主的运动，试图改善呼吸状况。
白天的相关表现
白天嗜睡： 患者白天常常感到困倦、想睡觉，尤其是在安静的环境中，比如坐着看电视、开会时很容易入睡。据统计，超过一半的呼吸暂停综合征患者白天会有明显的嗜睡表现，严重影响日常生活和工作。注意力不集中： 因为夜间睡眠质量差，大脑得不到充分休息，患者白天会出现注意力难以集中的情况，工作效率降低，比如在工作时容易走神，记不住事情。
可能伴随的其他症状
头痛： 部分患者晨起时会有头痛症状，可能与夜间呼吸暂停导致的血氧波动、二氧化碳潴留等因素有关。一般头痛程度轻重不一，有的患者表现为轻微的头胀，有的则是较明显的头痛。高血压： 呼吸暂停综合征与高血压关系密切，很多患者同时患有高血压，而且血压较难控制。研究发现，约30%的高血压患者合并有呼吸暂停综合征，呼吸暂停引起的缺氧和二氧化碳潴留会刺激血管收缩，升高血压。心慌、胸闷： 由于呼吸暂停影响心肺功能，患者可能会出现心慌、胸闷的症状，感觉心脏跳动异常，胸部有憋闷感，活动后可能会加重。