淋菌性咽炎主要通过抗生素治疗，一般使用头孢曲松等药物，通常规范治疗后可取得较好效果。
药物选择原则
抗生素为主： 淋菌性咽炎是由淋病奈瑟菌感染引起，治疗主要选用抗生素。头孢曲松是常用的抗生素之一，它能抑制淋病奈瑟菌的生长繁殖。一般来说，单次大剂量使用头孢曲松对淋菌性咽炎有较好的治疗作用。
治疗中的注意事项
性伴侣同时检查治疗： 在治疗淋菌性咽炎期间，患者的性伴侣也需要同时进行检查和治疗。因为淋病是一种性传播疾病，性伴侣很可能也被感染，如果不同时治疗，治愈后的患者可能会再次被性伴侣传染，导致病情反复。治疗后复查： 患者在完成抗生素治疗后，通常需要在1 - 2周内进行复查。通过检测分泌物等方式，确认淋病奈瑟菌是否被彻底清除。如果复查结果呈阳性，可能需要调整治疗方案。
特殊人群的情况
孕妇患者： 孕妇感染淋菌性咽炎时，用药需要特别谨慎。不能随意使用可能对胎儿有影响的抗生素。一般会选择对胎儿影响较小的抗生素，如头孢曲松，但具体的用药剂量和疗程需要由医生根据孕妇的具体情况严格制定，以确保既能有效治疗孕妇的淋菌性咽炎，又能保障胎儿的安全。儿童患者： 儿童患淋菌性咽炎比较少见，但如果发生，治疗时要格外注意药物的选择和剂量。因为儿童的肝肾功能发育还不完善，需要选择对儿童相对安全的抗生素，并且严格按照儿童的体重等因素来确定合适的用药剂量，避免使用可能对儿童生长发育造成不良影响的药物。