头上皮脂腺囊肿主要是由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。一般来说，毛囊皮脂腺开口堵塞是引发头上皮脂腺囊肿的关键因素。
毛囊皮脂腺开口堵塞原因一：皮肤卫生状况不佳
如果长时间不注意头部清洁，头皮上的灰尘、油脂、角质等物质就容易堆积，从而堵塞毛囊皮脂腺的开口。比如，一些人因为工作繁忙或者懒惰，好几天才洗一次头，这就增加了头上长皮脂腺囊肿的风险。
毛囊皮脂腺开口堵塞原因二：皮肤损伤影响
头部皮肤受到外伤，如擦伤、抓伤等，在伤口愈合过程中，可能会导致毛囊皮脂腺开口被堵塞。例如，头部不小心被尖锐物体刮伤，伤口周围的皮肤组织在修复时，有可能使得皮脂腺的排泄管不通畅，进而引发囊肿。
毛囊皮脂腺开口堵塞原因三：内分泌因素影响
青春期时，人体内的雄激素水平升高，会使皮脂腺分泌旺盛。如果皮脂腺分泌的皮脂过多，而排泄管又不能及时将皮脂排出，就容易造成开口堵塞。像十几岁的青少年，由于内分泌变化，头上长皮脂腺囊肿的情况相对较多见。
毛囊皮脂腺开口堵塞原因四：饮食生活习惯影响
长期食用高糖、高脂肪的食物，也可能影响皮脂腺的正常分泌和排泄。比如经常吃油炸食品、甜品等，会促使皮脂腺分泌更多皮脂，增加毛囊皮脂腺开口堵塞的几率。另外，长期熬夜、精神压力过大等也可能影响内分泌平衡，间接导致皮脂腺开口堵塞，引发头上皮脂腺囊肿。