怀孕三个月肚子胀可能是多种原因引起的。一般来说，怀孕后体内激素变化、子宫增大以及胃肠功能改变等都可能导致肚子胀，大约有60% - 70%的孕妇在孕期会出现不同程度的腹胀情况。
激素变化影响
孕激素作用： 怀孕后，体内孕激素水平升高，它会使胃肠道平滑肌的张力降低，蠕动减慢。比如原本胃肠正常的蠕动速度能及时推动食物消化和残渣排出，而孕激素升高后，这种正常的蠕动就会变慢，食物在胃肠道内停留时间延长，就容易产生胀气。绒毛膜促性腺激素影响： 怀孕后绒毛膜促性腺激素水平上升，它可能会抑制胃酸分泌，影响消化酶的活性，进而影响食物的消化过程，导致肚子胀。
子宫增大因素
早期子宫变化： 怀孕三个月时，子宫逐渐增大，虽然还没有超出盆腔，但已经开始对周围的肠道等器官产生压迫。肠道被挤压后，肠道内气体的排出就会不顺畅，气体积聚就会引起肚子胀。例如，正常情况下肠道有一定的空间来运行，子宫增大后就像给肠道“腾”出的空间变小了，气体就容易滞留。压迫位置影响： 子宫增大主要是向盆腔前方和上方挤压肠道，尤其是小肠部分，小肠受到压迫后，食物通过的速度减慢，气体也更难排出，从而加重腹胀感。
胃肠功能改变
消化能力下降： 孕妇在孕期胃肠的消化功能会有所降低。比如胃酸分泌减少，胃排空时间延长，吃进去的食物不能像孕前那样快速被消化吸收，就容易在胃肠道内发酵产生气体，引起肚子胀。一般怀孕后胃排空时间会从孕前的4 - 6小时延长到6 - 9小时。饮食习惯影响： 如果孕妇本身有一些不良的饮食习惯，比如吃了过多容易产气的食物，像豆类、洋葱、碳酸饮料等，再加上胃肠功能已经改变，就更容易出现肚子胀的情况。比如吃了大量豆类后，豆类在肠道被细菌分解会产生较多气体，而孕妇胃肠功能又弱，气体就更难排出。