毛囊炎的治疗需根据病情选择合适药物，一般局部外用药物较为常用，比如莫匹罗星软膏，它对革兰阳性球菌有很好的抗菌作用，能有效抑制毛囊炎部位的细菌感染，通常每天外用2 - 3次，涂抹于患处即可。
外用药物选择
莫匹罗星软膏： 属于外用抗生素，适用于细菌感染引起的毛囊炎，能杀灭局部的金黄色葡萄球菌等病菌，缓解红肿、疼痛等症状。夫西地酸乳膏： 也是外用抗生素，对多种革兰阳性菌有抗菌活性，可用于治疗毛囊炎，一般每天涂抹2 - 3次。
针对真菌感染的药物
酮康唑乳膏： 如果是真菌感染导致的毛囊炎，酮康唑乳膏就比较适用。它能抑制真菌细胞膜的合成，发挥抗真菌作用，使用时均匀涂抹在患处，一天1 - 2次。联苯苄唑乳膏： 同样用于治疗真菌引起的毛囊炎，通过抑制真菌的麦角甾醇合成，起到杀菌、抑菌的效果，每日外用一次。
严重情况的口服药物
头孢类抗生素： 当毛囊炎比较严重，有全身症状或者外用药物效果不佳时，可能会用到口服头孢类抗生素，如头孢呋辛等。这类药物能通过血液循环到达感染部位，杀灭细菌，但使用前需要确认患者不对头孢过敏。伊曲康唑： 如果是顽固的真菌性毛囊炎，可能会用到口服伊曲康唑，它对真菌有抑制作用，但需要在医生的指导下使用，因为它可能会对肝脏等有一定影响，用药期间需要监测肝功能。
日常注意事项
皮肤清洁： 要保持皮肤清洁干燥，尤其是容易长毛囊炎的部位，比如头皮、背部等，每天用温和的肥皂或沐浴露清洗，但要注意不要过度清洁，以免破坏皮肤屏障。避免刺激： 尽量避免搔抓、摩擦患处，防止炎症加重或者引起感染扩散。同时，要注意穿着宽松、透气的衣物，减少对皮肤的摩擦和压迫。