宝宝发烧39度且处于熟睡中，可通过饮食、冷敷、药物等方式来治疗。
一、饮食：当宝宝发烧39度处于熟睡状态时，需要叫醒孩子，给其少量多次喂温开水。这样能促进排泄，让热量被带走，从而降低体温。孩子清醒后体温调节能力会增强，对降温有帮助作用。
二、冷敷：宝宝发烧39度又在熟睡中，可采用冷敷方法。可将湿冷毛巾放在宝宝的手腕、额头、小腿处进行降温，当冷敷的毛巾温度升高后及时更换，如此重复能起到良好的辅助治疗效果。
三、药物：若宝宝发烧39度使用上述方式效果不佳，可在医生指导下使用抗病毒药物，如利巴韦林、阿昔洛韦、更昔洛韦等进行治疗，同时还可遵医嘱使用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚等解热镇痛药物进行治疗。
总之，对于宝宝发烧39度且熟睡的情况，要根据具体情况选择合适的方法进行治疗，以帮助宝宝尽快降温恢复健康。