肠胃不舒服发烧时需依据具体表现明确病因，并在医生指导下进行对因、对症治疗，常见于胃肠炎症。
一、细菌性胃肠炎：多由不当饮食引发，如进食不洁、生冷等刺激性食物可导致细菌性胃肠炎。一般会有恶心、呕吐、腹泻等表现，还可能伴有发热、脱水等症状。治疗上多选用抗生素，如左氧氟沙星。通常急性胃肠炎改善后，发热也会逐渐消退。若为高烧则需先给予退烧药物，如吲哚美辛，再进行其他处理。
二、病毒性胃肠炎：由病毒感染引起的急性胃肠炎症，发病症状常见腹痛、腹泻、水样便、恶心、呕吐、发烧等。治疗需对因、对症，可使用蒙脱石散抑制病毒、缓解腹泻，腹泻严重时还需补液治疗。
此外，一些呼吸道疾病如感冒也可能出现肠胃不舒服发烧的情况。提醒患者如果肠胃不舒服伴发烧、恶心、呕吐、腹泻等不适症状时，应及时前往医院就诊，切不可自行用药，以免延误病情。
总结：肠胃不舒服发烧可能由多种原因引起，包括细菌性和病毒性胃肠炎等，还可能与呼吸道疾病有关。治疗应根据具体病因进行，且不可自行用药，需及时就医以免延误病情。