肛门乳头瘤常见的症状有肛门肿物脱出，早期较小的乳头瘤可自行回缩，较大的则需用手推回，部分患者可感觉肛门有异物感。一般来说，约10% - 15%的肛门乳头瘤患者会出现便血情况，多为粪便表面带血或便后手纸上有鲜血。
肛门肿物脱出表现
早期表现： 肛门乳头瘤初期较小，排便时可能偶尔脱出肛门外，脱出物通常较小，直径多在0.5 - 1厘米左右，便后可自行缩回。进展期表现： 随着乳头瘤逐渐增大，脱出物会变大，直径可达1 - 2厘米甚至更大，便后需用手推才能回纳，严重时走路、咳嗽等腹压增加时也可脱出。
肛门异物感情况
轻度异物感： 部分患者仅感觉肛门处有轻微的异物摩擦感，就像有个小疙瘩在那搁着，不影响正常生活和排便。明显异物感： 随着乳头瘤增大，异物感会逐渐明显，患者能清晰感觉到肛门内有东西存在，影响日常活动，比如坐着时会感觉不舒服。
便血相关情况
出血程度： 便血一般量不多，多数患者是少量出血，血液颜色鲜红，与粪便不混合，只是附着在粪便表面。出血频率： 有的患者可能偶尔出现一次便血，有的则可能在排便较用力时经常出现便血，大概每月会有1 - 2次便血情况，但具体频率因个体差异有所不同。