口腔溃疡的发生通常与多种因素有关，比如大约有20%-30%的口腔溃疡是由遗传因素导致的，若家族中有多人反复出现口腔溃疡，那么其他人患病几率相对较高。
一、局部创伤因素
口腔内异物摩擦： 当口腔内有残根、残冠或者不合适的假牙时，这些异物会不断摩擦口腔黏膜，就容易引发口腔溃疡。比如有的患者戴了不合适的假牙一段时间后，相应部位就出现了溃疡。咬伤口腔黏膜： 吃饭时不小心咬伤口腔内侧黏膜，或者牙齿误咬到嘴唇、舌头等部位，伤口如果没有及时愈合，就可能发展成口腔溃疡。比如有人吃饭速度快，不小心咬到自己，之后就长了溃疡。
二、免疫系统因素
免疫力低下时易发病： 当人体免疫力降低时，比如感冒发烧、过度劳累、长期睡眠不足等情况，身体的免疫系统不能很好地抵御病原体，就容易让口腔溃疡找上门。像很多人熬夜后，过几天就可能长口腔溃疡。自身免疫性疾病关联： 一些自身免疫性疾病也可能引发口腔溃疡，比如白塞病，这类疾病会导致免疫系统攻击自身组织，口腔黏膜就容易出现反复溃疡的情况。
三、营养缺乏因素
维生素缺乏： 缺乏维生素B族，尤其是维生素B2、B6、B12等，会影响口腔黏膜的正常代谢，容易引发口腔溃疡。比如长期挑食、节食的人，就容易出现维生素缺乏从而长溃疡。微量元素缺乏： 缺锌、缺铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡有关。锌参与人体很多重要的生理过程，缺铁会影响血红蛋白的合成，进而影响口腔黏膜的健康，导致口腔溃疡发生。比如有的素食者可能容易出现缺铁性口腔溃疡。