口腔溃疡引起的原因有多种。一般来说，约20% - 30%的口腔溃疡与遗传因素有关，如果父母容易长口腔溃疡，子女患病几率相对较高。
一、局部创伤因素
口腔内机械性损伤： 比如刷牙时不小心用力过猛，刮伤了口腔黏膜；或者吃了比较坚硬的食物，像薯片、硬饼干等，划伤了口腔内壁，就容易引发口腔溃疡。这种情况下，创伤部位会先出现红肿，随后形成溃疡面，通常1 - 2周内可能会自行愈合，但如果创伤持续存在，溃疡可能会迁延不愈。牙齿残根残冠刺激： 口腔里有锐利的牙齿残根或者不合适的牙冠，长期摩擦口腔黏膜，也会导致口腔溃疡。例如，有一颗牙齿的残根比较尖锐，长时间摩擦对应的牙龈部位，就会反复出现溃疡，而且溃疡周围黏膜往往会有发红、发硬的表现。
二、营养缺乏因素
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B族，尤其是维生素B2、维生素B12时，容易引发口腔溃疡。比如长期饮食不均衡，只爱吃精米白面，而新鲜蔬菜、水果摄入过少的人，就容易缺乏这些维生素。一般来说，缺乏维生素B族导致的口腔溃疡，会伴有口角炎等其他表现，补充相应维生素后，溃疡情况会有所改善。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也可能与口腔溃疡有关。锌参与人体多种代谢过程，缺乏锌时，会影响细胞的正常修复和免疫功能，从而增加口腔溃疡的发生几率。比如一些素食者，由于植物性食物中锌的吸收利用率相对较低，就可能面临锌缺乏风险，进而容易长口腔溃疡。
三、免疫系统因素
自身免疫性疾病相关： 某些自身免疫性疾病，如白塞病，会频繁出现口腔溃疡，而且往往同时伴有眼部病变、生殖器溃疡等症状。白塞病是一种慢性自身免疫性疾病，其口腔溃疡具有反复发作的特点，溃疡比较深大，愈合时间也较长。免疫力低下时易发： 当人体免疫力低下时，比如感冒发烧、过度劳累、长期熬夜后，身体的抵抗力下降，就容易受到病原体的侵袭，从而引发口腔溃疡。例如，连续熬夜加班后，很多人会发现口腔里长出了溃疡，这就是因为免疫力暂时降低，导致口腔内原本潜伏的病菌活跃起来，引发了炎症反应形成溃疡。