早上起来小腿肌肉酸痛可能由多种原因引起。比如运动相关因素，若前一天进行了较长时间或较剧烈的运动，像跑步、爬山等，就容易导致小腿肌肉酸痛。一般来说，这种因运动引起的酸痛可能会持续1 - 3天。
运动相关因素导致
运动强度过大： 如果前一天进行了超出身体负荷的运动，比如突然增加了跑步的距离或速度，小腿肌肉在运动过程中会产生乳酸等代谢产物，当乳酸堆积过多时，早上起来就会感觉小腿肌肉酸痛。运动时间过长： 长时间的运动，像连续快走超过1小时，也会使小腿肌肉疲劳，进而出现酸痛情况。
肌肉拉伤因素
轻微拉伤： 在运动过程中，若姿势不当或者用力过猛，可能会造成小腿肌肉的轻微拉伤，即使当时没有明显感觉，但早上起来也会出现酸痛症状。拉伤程度判断： 轻微拉伤时，酸痛部位可能有轻度的压痛，但一般不影响正常行走，但活动时酸痛会加重。
寒冷刺激因素
夜间保暖不足： 晚上睡眠时如果小腿暴露在外，受到寒冷刺激，会导致小腿肌肉血管收缩，血液循环不畅，早上起来就容易出现酸痛。寒冷影响机制： 寒冷会使肌肉的代谢速度减慢，代谢产物不能及时被清除，从而堆积在肌肉中引起酸痛。
疾病因素
腰椎间盘突出： 当腰椎间盘突出压迫到支配小腿的神经时，也可能导致早上起来小腿肌肉酸痛。这种情况通常还会伴有下肢麻木等症状。下肢血管病变： 如下肢静脉曲张、静脉炎等血管疾病，会影响小腿的血液循环，也可能引发早上起来小腿肌肉酸痛，同时可能看到下肢血管异常的表现，如静脉曲张时腿部可见迂曲的静脉团。