早上起来小腿肌肉酸痛可能由多种原因引起。比如运动相关因素，若前一天进行了大量运动，尤其是无氧运动，像快跑、登山等，运动中产生的乳酸堆积就可能导致早上起来小腿肌肉酸痛，这种情况较为常见，一般经过休息等处理后会逐渐缓解。
运动相关因素
剧烈运动后： 当进行长时间或高强度的小腿肌肉运动时，如短跑、爬山等，肌肉会进行无氧呼吸产生乳酸。乳酸堆积在小腿肌肉中，就容易引起酸痛。一般这种情况经过1 - 2天的休息会有所缓解。运动方式不当： 如果运动前没有充分热身，突然进行剧烈的小腿肌肉活动，也可能导致早上起来肌肉酸痛。比如突然进行快速的跳绳运动，小腿肌肉没有适应，就容易出现酸痛状况。
疾病因素
腰椎间盘突出症： 突出的椎间盘可能压迫支配小腿肌肉的神经，从而引起小腿肌肉酸痛。除了酸痛外，还可能伴有下肢麻木、无力等症状。这种情况需要及时就医，通过影像学检查等明确诊断。下肢血管病变： 如下肢静脉曲张、下肢动脉粥样硬化等。下肢静脉曲张会导致血液回流不畅，早上起来可能出现小腿肌肉酸痛；下肢动脉粥样硬化会使下肢供血不足，也可能引发小腿肌肉酸痛，这类情况需要专业医生进行血管方面的检查来确诊。
其他因素
寒冷刺激： 夜间睡眠时如果小腿肌肉受凉，血管收缩，血液循环不畅，早上起来也可能出现酸痛。比如冬季睡觉时没有盖好被子，小腿暴露在寒冷环境中，就容易出现这种情况。缺钙： 当人体缺钙时，神经肌肉的兴奋性会增高，也可能导致小腿肌肉酸痛。尤其是中老年人、孕妇等人群容易缺钙，需要注意补充钙质，多吃富含钙的食物，如牛奶、豆制品等。