多囊卵巢综合症的病因目前尚未完全明确，可能与遗传因素和环境因素共同作用有关。有研究表明，约60%~70%的患者存在遗传易感性。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合症，那么女性成员患病的风险会增加。例如，母亲患有多囊卵巢综合症，其女儿患病的概率比正常人群高出数倍。基因层面影响： 一些特定的基因变异可能与多囊卵巢综合症的发生相关，这些基因会影响内分泌系统的调节，导致激素水平失衡等情况，从而引发多囊卵巢综合症。
内分泌因素方面
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）脉冲频率异常，会影响垂体分泌促卵泡生成素（FSH）和促黄体生成素（LH）的比例。正常情况下，FSH与LH的比例相对稳定，而在多囊卵巢综合症患者中，往往出现LH水平升高，FSH水平相对不足的情况，这会导致卵巢内卵泡发育异常，不能正常排卵。胰岛素抵抗因素： 约50%的多囊卵巢综合症患者存在胰岛素抵抗。胰岛素抵抗是指机体对胰岛素的敏感性降低，为了维持正常的血糖水平，胰腺会分泌更多的胰岛素，形成高胰岛素血症。高胰岛素血症会刺激卵巢分泌过多的雄激素，进一步干扰卵巢的正常排卵功能，同时还会影响其他内分泌指标，加重多囊卵巢综合症的症状。
生活方式因素方面
饮食不均衡： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食，会导致身体肥胖，而肥胖是多囊卵巢综合症的重要危险因素之一。例如，经常食用油炸食品、甜食等，会使体内脂肪堆积，影响内分泌平衡。缺乏运动： 长期缺乏体育锻炼，身体代谢减缓，也容易引发胰岛素抵抗等问题，增加多囊卵巢综合症的发病风险。比如，每天久坐不动，很少进行有氧运动，就可能为多囊卵巢综合症的发生埋下隐患。