三个月胎停的原因包括以下几方面：
一、胚胎染色体异常：这是致使妊娠早期胎停的常见原因。因为女性卵子或男性精子携带基因遗传和染色体异常，即便精子与卵子成功结合发育成受精卵，胚胎也无法正常发育，进而引发三个月胎停。
二、异常子宫结构：当母亲的子宫结构存在异常时，就可能导致胚胎发育欠佳，从而引起胎停，比如母亲的未成熟子宫、子宫纵隔、双子宫等情况。
三、孕妇并发症：若孕妇患有严重的糖尿病、高血压以及甲状腺疾病等，可能会由于血糖控制不理想、高血压或者甲状腺激素水平异常而产生严重并发症，最终导致胎停。
除了上述提到的原因外，还可能是宫腔环境不良、内分泌失调等所造成。因此建议及时就医，明确病因后进行规范化治疗。
总结：三个月胎停的原因有多种，包括胚胎染色体异常、子宫结构异常、孕妇并发症等，也可能与宫腔环境和内分泌失调有关，出现这种情况要尽快就诊明确病因并治疗。