女性小肚子两边隐隐作痛可能由以下原因引起：剧烈运动、局部淋巴结炎、附件炎、盆腔炎。
一、剧烈运动：女性若进行了较为剧烈的运动，可能会导致下肢肌肉以及韧带出现拉伤情况，进而引发小肚子两边隐隐作痛的现象。
二、局部淋巴结炎：
1.当女性存在下肢皮肤感染、肛周脓肿等问题时，有可能引发腹股沟淋巴结炎，从而导致小肚子两边隐隐作痛。
三、附件炎：
1.要是女性抵抗力较弱，或者在月经期间不注重卫生，可能会有细菌感染的情况发生，此时便会出现小肚子两边隐隐作痛的状况，同时还可能伴有白带增多、腰疼、月经失调等表现。
四、盆腔炎：
1.女性进行宫内节育环置取术、刮宫术等宫腔内手术操作时，若没有严格按照无菌操作进行，就可能诱发细菌感染，进而出现小肚子两边隐隐作痛的情况，并且还会伴有白带增多、月经增多、痛经等症状。
总之，当女性出现小肚子两边隐隐作痛时，可能是多种因素导致的，需要结合具体情况进行综合判断和分析，必要时应及时就医进行进一步检查和诊断，以便明确原因并采取相应的治疗措施。