女性小肚子两边隐隐作痛可能由以下原因引起：剧烈运动、局部淋巴结炎、附件炎、盆腔炎。
一、剧烈运动：
1.女性进行较为剧烈的运动后，可能导致下肢肌肉、韧带等出现拉伤情况，进而引发小肚子两边隐隐作痛的表现。
二、局部淋巴结炎：
1.当女性存在下肢皮肤感染、肛周脓肿等问题时，有可能引发腹股沟淋巴结炎，此时就会出现小肚子两边隐隐作痛的现象。
三、附件炎：
1.若女性抵抗力较弱，或者在月经期间没有良好的卫生习惯，容易遭受细菌感染，从而出现小肚子两边隐隐作痛的状况，同时往往伴有白带增多、腰疼、月经失调等情况。
四、盆腔炎：
1.在女性进行宫内节育环置取术、刮宫术等宫腔内手术操作时，若没有严格按照无菌操作进行，就可能诱发细菌感染，进而导致小肚子两边隐隐作痛，同时还会伴有白带增多、月经增多、痛经等症状。
总结提示：女性小肚子两边出现隐隐作痛有多种可能的原因，需要结合具体情况进行综合判断和分析，以便明确病因并采取合适的治疗措施。