小孩晚上磨牙的原因有多种。比如肠道寄生虫感染是常见原因之一，像蛔虫等寄生虫在肠道内活动，可能会导致小孩晚上磨牙，据统计约有10% - 20%的磨牙儿童与肠道寄生虫有关。
一、口腔因素
牙齿咬合问题： 如果小孩的牙齿排列不整齐，上下牙齿咬合关系不正常，比如存在牙列拥挤、牙齿缺损、牙齿过长等情况，就容易在晚上睡觉的时候出现磨牙现象。比如有些小孩可能因为乳牙早失，导致相邻牙齿移位，使得咬合关系紊乱，从而引发磨牙。口腔疾病影响： 口腔内有炎症，像牙龈炎、牙周炎等，或者患有龋齿（蛀牙），牙齿有疼痛不适时，也可能会通过神经反射引起磨牙。例如小孩牙龈发炎肿痛，就可能在睡眠中出现不自觉的磨牙情况。
二、神经系统因素
神经兴奋与抑制失衡： 小孩在白天过度兴奋或者紧张，比如玩耍过于剧烈、看了刺激性的电视节目等，到了晚上睡觉的时候，大脑皮层的兴奋灶可能还没有完全抑制，就可能导致咀嚼肌不自主收缩，出现磨牙。还有一些小孩可能因为学习压力等因素，精神长期处于紧张状态，也容易引发晚上磨牙。比如有的小学生因为考试压力大，晚上睡觉就容易磨牙。
三、全身性因素
营养不均衡： 如果小孩挑食、偏食，导致体内缺乏某些营养物质，像缺乏维生素D、钙等，会影响神经系统的稳定性，从而引起磨牙。例如缺乏维生素D时，会影响钙的吸收和利用，导致神经肌肉兴奋性增高，出现磨牙症状。其他疾病影响： 一些全身性疾病也可能导致小孩晚上磨牙，比如内分泌紊乱、胃肠功能紊乱等。像患有胃肠功能紊乱的小孩，胃肠道消化功能不好，晚上睡觉时可能也会出现磨牙情况。