喝豆浆后腹泻可能是多种原因导致的。比如，有些人可能是因为体内缺乏分解豆浆中寡糖的酶，大约有2%~10%的人存在这种情况，喝豆浆后就容易出现腹泻。
乳糖不耐受相关情况
肠道乳糖酶不足： 豆浆本身不含乳糖，但如果是同时存在乳糖不耐受的情况，可能会影响肠道对豆浆的消化吸收。正常情况下，乳糖需要乳糖酶分解才能被吸收，乳糖不耐受者体内乳糖酶缺乏或活性低，喝了含乳糖的食物会有不适，但豆浆不含乳糖，不过如果是同时饮用了含乳糖的饮品或食用了含乳糖的食物后又喝豆浆，可能会加重肠道负担导致腹泻。一般这种情况在饮用含乳糖食物后短时间内就可能出现反应。个体差异影响： 不同人的肠道对豆浆的适应能力不同，有些人肠道较为敏感，即使体内不缺乏分解豆浆寡糖的酶，喝了豆浆也可能出现肠道蠕动加快等情况从而导致腹泻。
豆浆本身因素
未煮熟： 如果豆浆没有完全煮熟，其中含有的胰蛋白酶抑制剂等物质可能刺激肠道。生豆浆中含有胰蛋白酶抑制剂，它会抑制人体胰蛋白酶的活性，影响蛋白质消化吸收，未煮熟的豆浆喝下去可能导致肠道不适引发腹泻。一般未煮熟的豆浆饮用后1~2小时内可能出现腹胀、腹泻等症状。豆浆质量问题： 如果豆浆被细菌污染等，也会引起腹泻。比如制作豆浆的原料不新鲜，或者盛放豆浆的容器未清洁干净等，导致豆浆被细菌等污染，饮用后细菌在肠道内繁殖，引起肠道感染性腹泻，这种情况可能在饮用后数小时内就出现腹泻症状，还可能伴有腹痛、恶心等。
过敏因素
豆浆蛋白过敏： 个别人群对豆浆中的蛋白质过敏，免疫系统将豆浆蛋白识别为外来抗原，引发免疫反应，影响肠道功能导致腹泻。这种过敏反应一般在饮用豆浆后较快出现，可能在15分钟~2小时内就会出现皮肤瘙痒、皮疹、腹泻等症状。如果本身已知对豆类过敏，那喝豆浆就更容易出现腹泻等过敏表现。