来大姨妈腰疼主要是因为前列腺素分泌增加等原因。女性来月经时，子宫内膜会合成并释放较多前列腺素，前列腺素增多可引起子宫平滑肌过强收缩、血管痉挛，造成子宫缺血、缺氧状态，从而出现腰疼，约有60%的女性在经期会有不同程度的腰疼情况。
激素变化影响
黄体素变化： 月经期间体内黄体素水平改变，可能会影响腰部肌肉和筋膜的张力，导致腰疼。一般在月经来潮前几天，黄体素开始有变化，部分女性就会逐渐感觉到腰部不适。雌激素影响： 雌激素水平波动也可能对腰部产生作用，它会影响身体的水盐代谢，当水钠潴留时，可能会加重腰部的肿胀感，进而引发腰疼。
子宫位置异常
后位子宫： 有些女性子宫是后位的，月经期间，子宫收缩排出经血时，后位子宫可能会对周围组织产生牵拉，从而引起腰疼。这种情况在已婚已育女性中相对常见一些。前倾前屈子宫过度倾屈： 如果子宫过度前倾前屈，在月经时子宫收缩排出经血不太顺畅，也可能刺激周围神经引起腰疼。
盆腔充血因素
盆腔充血严重： 月经期间盆腔处于充血状态，当盆腔充血比较严重时，会刺激腰部的神经，导致腰疼。一般月经前1 - 2天盆腔充血开始明显，腰疼可能也会随之加重。血流不畅引发： 要是盆腔内血液循环不畅，经血排出受阻，会使子宫收缩加强，进而牵扯腰部组织引起疼痛。比如本身有盆腔炎症等情况的女性，经期盆腔充血本就更明显，腰疼往往会更突出。