脑积水通常是由多种原因引起的。比如先天性因素，像胎儿在发育过程中，神经管发育异常等情况，就可能导致脑积水，这种先天性的脑积水在新生儿中的发生率约为0.5% - 1%左右。
先天性因素导致
神经管发育畸形： 在胚胎时期，神经管闭合过程出现障碍，就容易引发脑积水。例如脊柱裂合并脊髓脊膜膨出时，常常会伴随脑积水的发生。遗传因素： 某些遗传基因突变可能影响脑脊液的循环和吸收，从而增加脑积水的发生风险。比如一些与脑脊液代谢相关的基因发生突变，就可能导致脑积水。
后天性因素导致
颅内感染： 比如化脓性脑膜炎、结核性脑膜炎等颅内感染性疾病，炎症会导致脑脊液循环通路受阻。像化脓性脑膜炎患者，炎症渗出物可能堵塞蛛网膜颗粒，影响脑脊液的吸收，进而引发脑积水。颅内出血： 新生儿产伤导致的颅内出血，或者外伤引起的颅内出血，如果血液没有及时吸收，就可能阻塞脑脊液的循环通道。例如新生儿颅内出血后，血凝块可能堵塞脑室系统的通路，引起脑积水。颅内肿瘤： 颅内的肿瘤会占据空间，压迫脑脊液循环通路。比如颅后窝的肿瘤，可能会阻塞第四脑室出口，导致脑脊液循环受阻，引发脑积水。
其他因素导致
蛛网膜下腔出血： 蛛网膜下腔出血后，血液会刺激蛛网膜颗粒，影响脑脊液的吸收，进而导致脑积水。一般在蛛网膜下腔出血后的几周至数月内，可能会出现脑积水的情况。维生素缺乏： 孕妇在孕期严重缺乏维生素A等营养物质，可能会影响胎儿脑部的发育，增加胎儿出生后患脑积水的可能性。