运动完头疼可能由多种原因引起。一般来说，运动时身体代谢加快，血液循环改变等因素可能导致头疼。比如，有研究发现，约20% - 30%的人在运动后会出现头疼情况。
一、体温变化相关
体温上升引发：运动时身体产热增加，体温会有一定程度升高。当体温升高到一定程度，可能刺激头部血管，导致血管扩张，从而引发头疼。一般运动后体温升高幅度在1 - 2℃左右时，就可能出现这种因体温变化导致的头疼。散热不畅导致：如果运动环境温度较高，通风又不好，运动时身体散热困难，体温持续升高，也容易引起头疼。比如在温度30℃以上、通风差的环境中运动，就更易出现因散热问题引发的头疼。
二、脑部供血变化因素
供血短时间波动：运动时，身体血液重新分配，流向肌肉的血液增多，脑部供血相对短时间减少。当脑部供血减少到一定程度，就可能引起头疼。通常运动强度较大时，脑部供血减少的幅度能达到10% - 15%。血压波动影响：运动还可能引起血压波动，运动时血压升高，运动后血压可能短时间内下降，这种血压的波动也会影响脑部血液供应，进而导致头疼。一般运动后血压下降幅度在10 - 20mmHg左右时，就可能诱发头疼。
三、呼吸相关原因
呼吸节奏紊乱：运动时如果呼吸节奏紊乱，比如呼吸过快、过浅，会导致体内二氧化碳排出过多，血液中二氧化碳浓度降低，引起脑血管收缩，从而引发头疼。一般每分钟呼吸次数超过30次且节奏紊乱时，就较易出现因呼吸问题导致的头疼。缺氧情况出现：另外，如果运动强度过大，身体耗氧量增加，而肺部通气不足，就会出现轻度缺氧情况，也可能引发头疼。比如进行高强度运动时，血氧饱和度可能会下降2% - 5%，进而导致头疼。